高效液相色譜儀廣泛用于合成化學(xué)、石油化學(xué)、生命科學(xué)、臨床化學(xué)、藥物研究、環(huán)境監(jiān)測、食品檢驗及法學(xué)檢驗等領(lǐng)域。

一. 在食品分析中的應(yīng)用

1．食品營養(yǎng)成分分析：蛋白質(zhì)、氨基酸、糖類、色素、維生素、香料、有機酸（鄰苯二甲酸、檸檬酸、蘋果酸等）、有機胺、礦物質(zhì)等；

2．食品添加劑分析：甜味劑、防腐劑、著色劑（合成色素如檸檬黃、莧菜紅、靛藍、胭脂紅、日落黃、亮藍等）、抗氧化劑等；

3、食品污染物分析：霉菌毒素（黃曲霉毒素、黃桿菌毒素、大腸桿菌毒素等）、微量元素、多環(huán)芳烴等。

二. 在環(huán)境分析中的應(yīng)用

    多環(huán)芳烴（特別是稠環(huán)芳烴）、農(nóng)藥（如氨基甲酸脂類，反相色譜）殘留等。

三. 在生命科學(xué)中的應(yīng)用

    HPLC技術(shù)目前已成為生物化學(xué)家和醫(yī)學(xué)家在分子水平上研究生命科學(xué)、遺傳工程、臨床化學(xué)、分子生物學(xué)等必不可少的工具。其在生化領(lǐng)域的應(yīng)用主要集中于兩個方面：

1. 低分子量物質(zhì)，如氨基酸、有機酸、有機胺、類固醇、卟啉、糖類、維生素等的分離和測定。

2. 高分子量物質(zhì)，如多肽、核糖核酸、蛋白質(zhì)和酶（各種胰島素、激素、細胞色素、干擾素等）的純化、分離和測定。

    過去對這些生物大分子的分離主要依賴于等速電泳、經(jīng)典離子交換色譜等技術(shù)，但都有一定的局限性，遠遠不能滿足生物化學(xué)研究的需要。因為在生化領(lǐng)域中經(jīng)常要求從復(fù)雜的混合物基質(zhì)，如培養(yǎng)基、發(fā)酵液、體液、組織中對感性趣的物質(zhì)進行有效而又特異的分離，通常要求檢測限達ng級或pg級，或pmol，fmol，并要求重復(fù)性好、快速、自動檢測；制備分離、回收率高且不失活。在這些方面，HPLC具有明顯的優(yōu)勢。

四. 在醫(yī)學(xué)檢驗中的應(yīng)用

    體液中代謝物測定；藥代動力學(xué)研究；臨床藥物監(jiān)測：

 1. 合成藥物：抗生素、抗憂郁藥物（冬眠靈、氯丙咪嗪、安定、利眠寧、苯巴比妥等）、黃胺類藥等。

 2. 天然藥物生物堿（吲哚堿、顛茄堿、鴉片堿、強心甙）等

五．在無機分析中的應(yīng)用

 陽、陰離子的分析等。