食品一直是我國關注的民生問題之一，在食品標準中，除了對農藥、獸藥、重金屬、生物毒素四大類有害污染物的嚴格檢測，對致病菌也同樣在2016年出臺了全新的食品檢測標準——《GB 4789.1‐2016 食品國家標準食品微生物學檢驗 總則》。

其中檢測要求包括有大腸菌群、沙門氏菌、志賀氏菌等等共二十余種致病菌。而這些菌類檢測往往需要利用多種方式共同確定。

而熒光顯微鏡由于免疫熒光微菌落法的廣泛運用，得以被大力推行。

只要采用標記有特異性熒光抗體，在含有相應性抗原的免疫液體增菌液中粘連性分裂增殖，經培養后，形成免疫熒光微菌落，在熒光顯微鏡下易被觀察到。

擁有較好的特異性前提，且具有良好的靈敏度，操作也簡便。由此可見，熒光顯微鏡逐漸成為食品領域內不可或缺的試驗儀器。